Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NudcO35685 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NudcO35685 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NudcO35685 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NudcO35685 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NudcO35685 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NudcO35685 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NudcO35685 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NudcO35685 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NudcO35685 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NudcO35685 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NudcO35685 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NudcO35685 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NudcO35685 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NudcO35685 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NudcO35685 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NudcO35685 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NudcO35685 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NudcO35685 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NudcO35685 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NudcO35685 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NudcO35685 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NudcO35685 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NudcO35685 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NudcO35685 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NudcO35685 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NudcO35685 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NudcO35685 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NudcO35685 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NudcO35685 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NudcO35685 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NudcO35685 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NudcO35685 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NudcO35685 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NudcO35685 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NudcO35685 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NudcO35685 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NudcO35685 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NudcO35685 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NudcO35685 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NudcO35685 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NudcO35685 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NudcO35685 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NudcO35685 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NudcO35685 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NudcO35685 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NudcO35685 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NudcO35685 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NudcO35685 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NudcO35685 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NudcO35685 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NudcO35685 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NudcO35685 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NudcO35685 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NudcO35685 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NudcO35685 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NudcO35685 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NudcO35685 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NudcO35685 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NudcO35685 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NudcO35685 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NudcO35685 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NudcO35685 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NudcO35685 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NudcO35685 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NudcO35685 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NudcO35685 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NudcO35685 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NudcO35685 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NudcO35685 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NudcO35685 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NudcO35685 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NudcO35685 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NudcO35685 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NudcO35685 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NudcO35685 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NudcO35685 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NudcO35685 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NudcO35685 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NudcO35685 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NudcO35685 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NudcO35685 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NudcO35685 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NudcO35685 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NudcO35685 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NudcO35685 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NudcO35685 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NudcO35685 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NudcO35685 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NudcO35685 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NudcO35685 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NudcO35685 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NudcO35685 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NudcO35685 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NudcO35685 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NudcO35685 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NudcO35685 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NudcO35685 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NudcO35685 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NudcO35685 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms