Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pkd2O35245 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms