Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArxO35085 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArxO35085 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArxO35085 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArxO35085 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArxO35085 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArxO35085 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArxO35085 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArxO35085 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArxO35085 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArxO35085 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArxO35085 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArxO35085 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArxO35085 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArxO35085 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArxO35085 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArxO35085 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArxO35085 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArxO35085 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArxO35085 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArxO35085 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ArxO35085 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArxO35085 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArxO35085 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArxO35085 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArxO35085 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArxO35085 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArxO35085 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArxO35085 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArxO35085 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArxO35085 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArxO35085 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArxO35085 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArxO35085 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArxO35085 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ArxO35085 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ArxO35085 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ArxO35085 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ArxO35085 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ArxO35085 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ArxO35085 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ArxO35085 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ArxO35085 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ArxO35085 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ArxO35085 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ArxO35085 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ArxO35085 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ArxO35085 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ArxO35085 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArxO35085 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArxO35085 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArxO35085 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArxO35085 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArxO35085 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArxO35085 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArxO35085 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArxO35085 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArxO35085 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArxO35085 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArxO35085 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArxO35085 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArxO35085 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArxO35085 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ArxO35085 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArxO35085 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArxO35085 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArxO35085 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArxO35085 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArxO35085 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArxO35085 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ArxO35085 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ArxO35085 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ArxO35085 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ArxO35085 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ArxO35085 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ArxO35085 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ArxO35085 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ArxO35085 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ArxO35085 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ArxO35085 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ArxO35085 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ArxO35085 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ArxO35085 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ArxO35085 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ArxO35085 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ArxO35085 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ArxO35085 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ArxO35085 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ArxO35085 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArxO35085 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArxO35085 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArxO35085 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArxO35085 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArxO35085 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArxO35085 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArxO35085 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArxO35085 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArxO35085 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArxO35085 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArxO35085 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms