Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Degs1O09005 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Degs1O09005 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Degs1O09005 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Degs1O09005 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Degs1O09005 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Degs1O09005 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Degs1O09005 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Degs1O09005 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Degs1O09005 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Degs1O09005 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Degs1O09005 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Degs1O09005 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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