Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ltbp2O08999 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ltbp2O08999 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms