Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PrkcshO08795 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms