Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dctn1O08788 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms