Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltaO08585 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CltaO08585 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CltaO08585 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CltaO08585 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CltaO08585 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CltaO08585 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CltaO08585 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CltaO08585 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CltaO08585 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltaO08585 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltaO08585 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltaO08585 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltaO08585 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltaO08585 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltaO08585 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltaO08585 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CltaO08585 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltaO08585 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltaO08585 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltaO08585 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CltaO08585 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltaO08585 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltaO08585 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltaO08585 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CltaO08585 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CltaO08585 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CltaO08585 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltaO08585 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltaO08585 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltaO08585 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltaO08585 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltaO08585 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltaO08585 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CltaO08585 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltaO08585 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltaO08585 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltaO08585 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltaO08585 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltaO08585 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CltaO08585 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltaO08585 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltaO08585 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltaO08585 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltaO08585 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltaO08585 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltaO08585 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltaO08585 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltaO08585 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CltaO08585 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CltaO08585 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CltaO08585 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CltaO08585 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CltaO08585 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CltaO08585 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CltaO08585 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltaO08585 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltaO08585 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltaO08585 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltaO08585 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltaO08585 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltaO08585 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltaO08585 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltaO08585 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltaO08585 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltaO08585 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltaO08585 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltaO08585 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltaO08585 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltaO08585 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltaO08585 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltaO08585 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltaO08585 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltaO08585 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltaO08585 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltaO08585 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltaO08585 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltaO08585 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltaO08585 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltaO08585 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltaO08585 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltaO08585 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltaO08585 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltaO08585 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltaO08585 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltaO08585 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltaO08585 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltaO08585 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltaO08585 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltaO08585 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltaO08585 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CltaO08585 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltaO08585 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltaO08585 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltaO08585 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltaO08585 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltaO08585 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltaO08585 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CltaO08585 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CltaO08585 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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