Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl4M0QW46 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl4M0QW46 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms