Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3278L7N2D2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3278L7N2D2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3278L7N2D2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms