Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4340L7N2C4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm4340L7N2C4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4340L7N2C4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4340L7N2C4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4340L7N2C4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4340L7N2C4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4340L7N2C4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4340L7N2C4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms