Protein–RNA interactions for Protein: L7N2A3

Gm2244, Predicted gene 2244, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2244L7N2A3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm2244L7N2A3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2244L7N2A3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm2244L7N2A3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2244L7N2A3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2244L7N2A3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2244L7N2A3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2244L7N2A3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2244L7N2A3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2244L7N2A3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2244L7N2A3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2244L7N2A3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2244L7N2A3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms