Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm5458L7N219 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm5458L7N219 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm5458L7N219 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm5458L7N219 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm5458L7N219 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5458L7N219 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm5458L7N219 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm5458L7N219 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm5458L7N219 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm5458L7N219 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5458L7N219 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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