Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm20877J3QPZ4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm20877J3QPZ4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm20877J3QPZ4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm20877J3QPZ4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm20877J3QPZ4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm20877J3QPZ4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm20877J3QPZ4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm20877J3QPZ4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20877J3QPZ4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm20877J3QPZ4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm20877J3QPZ4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm20877J3QPZ4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm20877J3QPZ4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm20877J3QPZ4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm20877J3QPZ4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm20877J3QPZ4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20877J3QPZ4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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