Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9602J3QPD5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms