Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5294J3QP53 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5294J3QP53 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5294J3QP53 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5294J3QP53 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5294J3QP53 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5294J3QP53 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5294J3QP53 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5294J3QP53 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5294J3QP53 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5294J3QP53 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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