Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21976J3QNN2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Gm21976J3QNN2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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