Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Gm17577J3QNF7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gm17577J3QNF7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gm17577J3QNF7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm17577J3QNF7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm17577J3QNF7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm17577J3QNF7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm17577J3QNF7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Gm17577J3QNF7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm17577J3QNF7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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