Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20918J3QN17 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms