Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms