Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700014D04RikJ3QMS2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms