Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3336J3QMQ6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3336J3QMQ6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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