Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AK157302I3ITR1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AK157302I3ITR1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms