Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn20G5E8X0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn20G5E8X0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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