Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubgcp6G5E8P0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tubgcp6G5E8P0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tubgcp6G5E8P0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms