Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17lcG5E8I7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17lcG5E8I7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms