Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms