Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chrna9G3X8Z7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna9G3X8Z7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms