Protein–RNA interactions for Protein: G3UXR8

Gm20532, Predicted gene 20532, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20532G3UXR8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20532G3UXR8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20532G3UXR8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms