Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Speer4cG3UXD1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Speer4cG3UXD1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms