Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Farp1F8VPU2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms