Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M1F7CXU4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms