Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms