Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pagr1bF6V0H0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pagr1bF6V0H0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms