Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3072F6SKY8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3072F6SKY8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms