Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm29094F6Q785 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm29094F6Q785 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms