Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms