Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc74aE9Q9U8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc74aE9Q9U8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms