Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp17lbE9Q9U0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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