Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Arhgef5E9Q7D5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Arhgef5E9Q7D5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Arhgef5E9Q7D5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
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