Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20518E9Q548 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20518E9Q548 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm20518E9Q548 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms