Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r238E9Q373 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r238E9Q373 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms