Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp558E9Q1J0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms