Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm3095E9Q058 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3095E9Q058 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms