Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm9972E9Q053 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm9972E9Q053 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms