Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ddx60E9PZQ1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddx60E9PZQ1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms