Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd2E9PZM4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd2E9PZM4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms