Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG8

9530053A07Rik, RIKEN cDNA 9530053A07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 2,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9530053A07RikE9PVG8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
9530053A07RikE9PVG8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9530053A07RikE9PVG8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms