Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc17E9PVB5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttc17E9PVB5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttc17E9PVB5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms