Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syde2E9PUP1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syde2E9PUP1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms