Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc78D3Z5T1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc78D3Z5T1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc78D3Z5T1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms